Con gái của Marguerite, Jeanne, sau này trở thành nữ vương của Navarra với tên hiệu Jeanne II. Quan hệ huyết thống cha con của Jeanne đã bị nghi ngờ vì có những cáo buộc Marguerite ngoại tình.

Năm 1361, quyền kế vị của Marguerite trở nên quan trọng trong cái chết sớm của Công tước Philippe I xứ Bourgogne (cháu của bà), vì những người thừa kế Bourgogne gần nhất là hậu duệ của Marguerite và em gái của bà, Jeanne. Cháu trai của Marguerite và người thừa kế Charles II của Navarra đã tuyên bố thừa kế ngôi công tước trên cơ sở trực hệ, nhưng con trai của Jeanne là Jean II của Pháp là tuyên bố quyền kế vị trên cơ sở cận huyết, gần hơn một thế hệ so với Philippe. Là vua, Jean cai trị theo ý mình, và trở thành Công tước xứ Bourgogne, sau đó ban chức danh Công tước cho con trai của mình, Philippe II xứ Bourgogne.